Il genere di una pianta è spesso (anche se non sempre) una buona guida per sapere quali piante sono compatibili con l'innesto.

Gli alberi di mele appartengono al genere Malus insieme alle molte specie di mele - ce ne sono più di 40, native di tutto l'emisfero settentrionale temperato. Le mele e i mirtilli insieme sono un raggruppamento grande e diversificato come tutti i frutti a nocciolo Prunus (prugne, pesche, nettarine, albicocche, mandorle e ciliegie) messi insieme.

Le mele da cucina sono quasi sempre innestate perché i loro semi non crescono fedeli alla cultivar, e la scelta del portinnesto è talvolta un melo. In alternativa, i crabapple ornamentali sono talvolta innestati su un portainnesto di mela da seme. L'innesto può aiutare ad ampliare la gamma di climi e tipi di terreno in cui un melo può crescere, dato che spesso c'è una specie di melo autoctono resistente su cui innestare una varietà più delicata.

Al di fuori del genere Malus, le mele sono forse più strettamente legate a Pyrus (pere), Mespilus (nespole) e Cydonia (cotogne). Anche i biancospini, le bacche di servizio e diversi altri generi sono correlati, con forse un po' meno somiglianza. Meli e peri sono stati innestati insieme molte volte, ma i risultati sono inaffidabili e l'innesto di solito fallisce entro pochi anni - i due gruppi di alberi sono troppo diversi. Le pere si innestano con un po' più di successo su un portainnesto di mela cotogna per creare un pero nano, e sia le mele cotogne che le pere possono innestarsi nelle nespole, che, secondo quanto riferito, sono compatibili con alcuni ananas.

Questo significa che si potrebbe, con il tempo, forse sviluppare un sistema per avere un ramo di melo che cresce da un gambo di melo che è innestato su un nespolo, poi una mela cotogna o una pera, e alla fine avere i due classici tipi di frutta che crescono dallo stesso albero, anche se non sarebbero in grado di attaccarsi direttamente l'uno all'altro. Ma il sistema sarebbe molto complesso, ogni segmento avrebbe diverse vulnerabilità alle malattie, tolleranza al freddo, e ore di freddo necessarie per rompere la dormienza, e un fallimento in qualsiasi sezione comporterebbe la morte di tutte le sezioni sovrastanti e la fine di tutto quel duro lavoro e ricerca.

Ci sono centinaia di varietà di mele e mele selvatiche tra cui scegliere e quindi milioni di potenziali combinazioni da provare ad innestare. Alcune specie o varietà all'interno di Malus potrebbero condividere abbastanza somiglianza con un parente stretto al di fuori del genere o essere abbastanza compatibili che i due potrebbero plausibilmente funzionare come innesto, ma non è stato provato. Se sei interessato all'innesto, potresti essere il primo a creare qualcosa di veramente interessante! Ma per tutti gli scopi pratici e commerciabili, per ora, mele e ananas sono partner affidabili e circa un accoppiamento esotico come si può ottenere.