Il problema principale dei vaccini è che non ne abbiamo ancora uno per ogni malattia. I vaccini stimolano una risposta del sistema immunitario che lascia il corpo con cellule B e T di memoria specifiche per un dato agente patogeno, di solito un virus. La volta successiva che si è esposti allo stesso agente patogeno, montiamo un attacco immunitario molto rapido su di esso, spesso così veloce che non sappiamo di essere stati reinfettati.

Altri problemi hanno a che fare con errori come la contaminazione, la durata di conservazione, o la necessità di refrigerazione.

Infine, con qualsiasi vaccino c'è la possibilità che alcuni individui sviluppino una grave reazione avversa al vaccino. Dalle mie ricerche, questo numero varia da circa 1 su 10.000 a 1 su 100.000 persone vaccinate, a seconda del vaccino in questione.

Ipotizzo che in un futuro non troppo lontano, saremo in grado di fare uno screening genetico di queste persone prima della vaccinazione, evitando così le vaccinazioni che causano effetti avversi. The CDC has a Vaccine Adverse Event Reporting System (VAERS), from which we can gauge the risks of various vaccines. The Vaccine Adverse Event Reporting System (VAERS) Request

Here’s an academic paper based on VAERS data:
http://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0002937813002226

This paper reports on two lethal events in Brazil after yellow fever vaccination. This is probably out of millions of doses administered, thus the risk is minuscule.
http://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0140673601053260